Prvá časť článku je zameraná na Zmluvu o fungovaní Európskej únie. Zmluva o fungovaní Európskej únie je primárnym prameňom európskeho práva a zakazuje takú právnu úpravu, ktorá je diskriminačná a v rozpore so základnými európskymi slobodami.
S účinnosťou od 1. 1. 2010 nadobudla účinnosť novela zákona č. 595/2003 Z. z. o dani z príjmov v z. n. p. (ďalej len „ZDP“), ktorá okrem iného priniesla rozsiahlu úpravu podnikových kombinácii (predaj a kúpa podniku alebo jeho časti, nepeňažný vklad, zlúčenie, splynutie alebo rozdelenie), ktorá nebola v slovenskej daňovej legislatíve dovtedy riešená. Cieľom tohto článku nie je poukázať len na súčasnú právnu úpravu zdaňovania reorganizácii v zmysle národnej legislatívy (platného ZDP), ale aj na základné pravidlá vyplývajúce z európskej legislatívy. Povinnosťou SR je totiž upraviť svoj daňový systém tak, aby nebol v rozpore s právom Európskej únie (EÚ).
Prvá časť článku je zameraná na Zmluvu o fungovaní EÚ, ktorá je súčasťou primárnych prameňov európskeho práva, druhá časť sa koncentruje na smernicu Rady 2009/133/ES o spoločnom systéme zdaňovania, uplatniteľnom pri zlučovaní, rozdeľovaní, čiastočnom rozdeľovaní, prevode aktív a výmene akcií spoločností rôznych členských štátov a pri premiestnení sídla európskej spoločnosti (tzv. Societa Europaea) alebo európskeho družstva (tzv. Societas Cooperativa Europaea) medzi členskými štátmi (ďalej len „Smernica o fúziách“), ktorá je považovaná za sekundárny prameň európskeho práva. Tretia časť článku sa venuje súčasnej úprave zdaňovania podnikových kombinácii v slovenskom ZDP.
Zmluva o fungovaní Európskej únie
Hoci je právna úprava priamych daní v kompetencii jednotlivých členských štátov EÚ je povinnosťou týchto štátov aby vykonávali svoju právomoc v súlade s právom EÚ. Inými slovami, členské štáty EÚ sú povinné upraviť svoj daňový systém tak, aby nebol v rozpore s európskym právom.
Zmluva o fungovaní EÚ (ďalej len „ZFEÚ“) (Pozn.: ZFEÚ bola pôvodne označovaná ako Zmluva o založení Európskeho spoločenstva. K jej premenovaniu na ZFEÚ došlo v dôsledku prijatia Lisabonskej zmluvy, ktorá nadobudla platnosť 1. 12. 2009 a ustanovila, že „Únia“ nahrádza „Európske spoločenstvo“.) je primárnym prameňom európskeho práva a zakazuje takú právnu úpravu, ktorá je diskriminačná a v rozpore so základnými európskymi slobodami.
Podľa Článku 258 ZFEÚ, ak sa Európska Komisia (ďalej len „Komisia“) domnieva, že si členský štát nesplnil povinnosť, ktorá pre neho vyplýva z tejto zmluvy alebo Zmluvy o Európskej únii, vydá odôvodnené stanovisko po tom, čo umožní tomuto štátu predložiť pripo